fopen_sでオープンしたファイルのファイルサイズを取得するには、fseekでファイルポインタを終端に移動して、その位置をftellで取得すれば良い。このままファイルに対して作業するなら、fseekでファイルポインタを先頭に戻しておくことを忘れずに。
FILE *fp; long size; fopen_s(&fp, "test.bin", "rb"); fseek( fp, 0L, SEEK_END ); size = ftell( fp ); fseek( fp, 0L, SEEK_SET );